Белорусское правительство является основным партнером УВКБ ООН. Управление координирует свою деятельность с различными органами государственной власти, включая центральные и региональные миграционные службы, Министерство внутренних дел,  Государственный комитет пограничных войск и другие.

Представительство УВКБ ООН в Республике Беларусь работает с несколькими общественными организациями, которые являются партнерами-исполнителями, дополняя роль государства в таких сферах, как предоставление социальных услуг и медицинской помощи для наиболее уязвимых лиц, образование для детей-беженцев, юридическая помощь и представление беженцев в судах, создание положительного общественного мнения в отношении беженцев, профессиональное обучение и организация их занятости.

На протяжении 2003—2005 годов трем основным общинам беженцев в Минске, Гомеле и Гродно предоставлялась помощь для создания и регистрации общественных организаций.

Сегодня в Беларуси непосредственно представлены 11 организаций, программ и фондов системы ООН: ПРООН, ЮНИСЕФ, УВКБ ООН, ЮНЭЙДС, ЮНФПА, Всемирный банк, МФК, МВФ, МОТ, ВОЗ и ДОИ ООН.

УВКБ ООН поддерживает сотрудничество с Международной Федерацией Красного Креста по соответствующим гуманитарным вопросам.